1、滥用抗生素的危害
正确合理的使用抗生素，可以防治猪的疫病。如果长期的滥用抗生素，则对猪只会造成严重的危害。比如长期大量的使用庆大霉素、卡那霉素、四环素、链霉素与新霉素等抗生素，会严重损害动物机体免疫细胞的功能，抑制细胞免疫和体液免疫，降低猪只的免疫力和抗病力。有的抗生素还能影响疫苗的免疫效果，造成免疫失败。如卡那霉素、痢特灵等药物对猪体内的B淋巴细胞的增殖有抑制作用，干扰疫苗的免疫效果，造成免疫失败。
2、滥用抗生素可造成动物机体二重感染
抗生素在杀灭病原微生物(细菌、真菌、放线菌、螺旋体、立克次体、衣原体与霉形体等)的同时，对机体内的益生菌也有抑制与杀灭作用，造成猪只体内菌群失调、生态平衡受到破坏，某些条件性病原体大量繁殖，引发机体二重感染，并产生耐药性菌株，给猪病的防控带来很大的麻烦，产生严重的不良后果。
3滥用抗生素易产生耐药性菌株，诱发“超级细菌”的出现
养猪生产中超剂量、长时间的滥用抗生素，不仅造成药物的浪费，增大成本支出；严重时可引起毒性反应、过敏反应与二重感染，甚至造成猪只死亡。如长期大量的使用青霉素类药物，可干扰凝血机制而造成出血和中枢神经系统中毒，引起猪只发生抽搐，大小便失禁，严重者出现瘫痪症状。长期使用链霉素、庆大霉素、卡那霉素、新霉素和大观霉素等抗生素，对第八对脑神经和肾脏有损害作用，造成神经肌肉接头阻滞作用，引起猪只呼吸麻痹而死亡。头孢类药物、青霉素类及四环素类和磺胺类药物等长期使用可引起猪只肾脏毒性。
抗生素用量不足，用药时间过长，不仅达不到防治效果，而且严重的诱发细菌产生耐药性。当前猪场存在的链球菌、多杀性巴氏杆菌、放线杆菌、葡萄球菌、支原体，沙门氏菌与大肠杆菌等对青霉素、链霉素、庆大霉素、卡那霉素、四环素、土霉素、金霉素、红霉素、沙星类药物及磺胺类药物，某些头孢类药物等耐药性在不断提高，与日俱增。
4滥用抗生素易造成药物残留，对人体具有“三致”作用
抗生素的使用不遵守休药期，长期滥用，致使抗生素在猪体内产生药物残留，当人们食用带有药物残留的猪肉食品时，进入人体具有致癌、至畸、致突变作用，严重危害公共卫生的安全。如四环素类、磺胺类药物、氨基糖苷类（卡那霉素）、硝基呋喃类药物、砷制剂、苯丙咪唑及雌激素等对人体有致癌作用；青霉素、卡那霉素、喹诺酮类及磺胺类药物等能引起人们发生皮疹；氯霉素、磺胺类药物、两性霉素B、万古霉素、链霉素及呋喃类药物等可引发人们发生障碍性贫血；孕妇食用含有苯丙咪唑的动物性食品，可导致胎儿畸形，脚短和兔唇等，同时由于药物残留又能抑制免疫细胞的活性，故具有潜在的致突变作用，如引起人体细胞染色体发生突变。有不少抗生素对人体肝、肾及消化道有损害作用。
反思养殖观念，逐步减少抗生素的用量
我国的养猪场在猪只出生后不同的各个生长阶段都要大量使用抗生素，害怕猪只发病死亡，把抗生素当作是防控猪病的最好方式。在猪病防控中用的药品，抗生素是使用最乱的药品，我们要深刻地反思这种养殖观念，从思想观念，改造养殖环境，提供技术措施，逐步引导养猪场减少抗生素用量是完全可行的。科技是第一生产力，随着现代化科学技术的飞速发展，许多安全、无耐药性，无残留的新型药物不断出现，如细胞因子制剂、中药制剂及微生态制剂等，将会逐步取代抗生素的功能，这种发展趋势是任何人都无法阻挡的。那种“养猪离不开抗生素，离开抗生素就养不好猪”的思想是落后的，是十分有害的，应彻底将其抛弃。
加大对抗生素生产与经营市场的整顿力度
当前我国抗生素生产与经营市场比较混乱，要下决心进行严格的整顿。有的抗生素质量不稳定，粗制滥造；有的有效成分的含量不足，疗效极差；有的任意改变生产工艺，组合复方制剂，在中药制剂中私自添加化学药物，疗效不确切；还有无GMP生产厂家、无兽药批准文号、无产品质量标准的“三无”产品在市场上流动；有的饲料企业长期在饲料中添加抗生素（可能还存在禁用抗生素），误导用户使用等。