1、疫苗间的互相干扰。不同的疫苗免疫间隔应在1周以上，有的疫苗间隔应在2周以上。由于高频次地免疫，使两种疫苗免疫间隔时间太短，特别是1月龄内的雏鸡免疫时这种问题更为突出，有的养殖户在一个月内免疫新城疫3次，法氏囊、鸡痘、传支各2次，禽流感、肾传支、大肠杆菌、支原体各1次。更有甚者，只要听说有什么新疫苗就用什么疫苗，这样不科学防疫的结果不但免疫时对鸡会产生很大的应激反应，而且还容易因免疫疫苗间隔时间短，造成疫苗间的互相干扰，导致免疫失败。
2、加重免疫应激。正常情况下给鸡免疫，因鸡挣扎、疼痛、免疫反应等因素可造成一定的应激反应，在大剂量、高频次免疫时更增加了免疫反应发生的几率或加重免疫应激反应。
3、免疫抑制。在一定限度下，机体产生抗体是随着抗原的增加而增加，但当大剂量、高频次接种疫苗，其抗原超过一定限量时则会起反作用，这样不但无谓地增加了防疫成本，而且还会造成鸡群免疫系统麻痹，产生免疫抑制，起不到免疫效果。
4、影响母源抗体。雏鸡在正常情况下存有较高的母源抗体，母源抗体水平随着日龄的增长逐渐降低。经检测，雏鸡在5日龄新城疫、法氏囊的抗体仍有较高的水平，若盲目追求超前免疫，势必影响母源抗体，与特异性抗体中和。有的养殖户在没有进行抗体检测、不知母源抗体水平高低的情况下，将新城疫、支气管、肾型传支三联苗提前至3日龄或1日龄免疫，既增大了应激反应的风险，又严重影响了防疫效果。