通过上述对疾病的调查，可对疾病的发生及流行情况提供一定程度的印象诊断基础，但最终确诊还需一系列综合的诊断方法和技术。还要进行群（个）体临床症状检查。
（一）精神状态及反应能力的检查 鳄在不同年龄、生理状态及饲养环境中，行为表现有一定差异。幼小鳄较成鳄活泼好动，种鳄在繁殖交配期精神状态兴奋，母鳄在孵化期会变得更加凶猛。每天投食前空腹时活动量增加，而喂饱后尤其在舒适的饲养环境条件下，可长时间地保持身体伸展，呼吸频率减慢，微闭双目呈安静休息姿态。在长期饲养条件下生活的鳄对异常音响、外来人员反应变得相对迟钝，但仍保持较迅速的反应能力。鳄患病后，会出现精神状态异常与反应能力下降的情况，如精神呆沉、头颈阵颤、扭曲，游泳及爬行速度迟缓、呈曲线运动或原地转圈、投食时对饲料反应速度下降，甚至用木棒等外物刺激也缺乏足够的反应能力。疾病种类不同表现有一定的差异。对病状较轻的鳄，仔细观察还可发现行动速度与持续能力相伴下降的情况。另外，当四肢骨或脊椎骨骨折时，可见到鳄出现姿势异常。
（二）觅食情况的检查
1．食欲 鳄的种类、年龄、个体、生理状态、饮食习惯等对喜食饲料的品种有一定差异，相应所表现出的食欲强弱也有所不同，但健康的鳄一般对鱼、鸡肉、畜兽肉等动物性饲料具有较强的喜食性。此外，食欲的强弱与鳄的饥饱状态也有关系。处于饥饿状态中的他康者，可明枯对与投食有关的操作、发出的声响、饲喂人员等的出现引起注意，较远距离即可嗅出饲料的气味．并表现出强烈的求食反应。
2．采食数量 鳄对饲料的消化速度及代谢强度直接影响到采食数量。因此在进行采食数量检查时应考虑到鳄的种类、年龄、生理状态、生长速度、环境温度、饲养季节、食物的营养特点（如含水量，易消化性及适口性）等因素可能对采食量带来的影响。在此项检查中，除要对有明显疾病症状的个体采食量进行独立检查外，还应特别注意每个群体总采食数量的变化，以达到早期揭示疾病的日的。
3．采食速度 鳄具有坚固而长的头盖骨，附近颌骨左右强有力的颌肌可很快将获取的口中食物压扁、挤碎，同时口腔中排列整齐、呈圆锥形尖锐的牙齿在水中即可把大块的食物撕碎，而对小块的食物则直接吞食，因此健康的鳄采食速度很快。患病鳄除食欲下降外，尚能见到采食速度降低，甚至只采食食物的某一部分。
4．采食异常 患病鳄在偶然的情况下可见到采食异常，如采食习惯与采食姿势的改变等。还可发现幼鳄因贪食而过度采食导致疾病的发生（如痛风）。
（三）体表外观检查
1．装甲与皮肤 鳄可称为强有力的装甲动物：一些种类的鳄在全身覆盖着已经骨化的宽大而坚固的鳞片，可对身体内部组织器官起到良好的保护作用和防御来自外界的各种伤害。而某些种类的鳄虽全身几乎没有鳞片，但有完整坚韧的皮肤来防止各种不良刺激对机体的侵袭和适应水中及阶地生活的需要。因此，完整、健康的装甲与皮肤对鳄更具有特殊作用。但是，鳄的体表皮肤温度较低，鳞片无血管，皮肤代谢相对较弱．自体恢复机能较差，当其受到损伤后，自身很易受到感染并给各种病原微生物侵人机体敞开了门户。鳄的皮肤易受损部位多见于吻端、腹下、四肢基部和足掌等部位。
2．口腔 鳄具有很大容积的口腔，当进行口腔检查时，应首先注意口腔豁膜的光洁度、颜色与完整性；其次要嗅闻口腔的气味；另外应检查牙齿有无缺失和损伤，牙龈部有无炎症冷鳄在张大口腔时，还可见到较深部日周喉区的明显病变。
3．眼及鼻 鳄在患某些疾病时，可表现眼部的病理变化．通常以双目变化为主，个别情况下也可发生单侧眼睛的损伤。眼部的病变可表现眼睑发炎，眼眶月子胀，重者可蔓延到眼外侧周围的皮肤，甚至扩散到整个头部。同时可在眼部见到炎性或脓性分泌物，严重时，可因视力障碍导：致采食困难。鼻区的病变主要为鼻内豁膜潮红、肿胀，鼻腔丙分泌物增多，严重时可对正常呼吸产生影响。
4．泄殖腔 鳄的泄殖腔位于其身体尾基部的腹侧，正常时几乎呈闭合状态，检查时可见开口不明显。病变时可见该区及周围皮肤发红、肿胀，用二手指翻开检查可发现泄殖腔私膜颜色变深、水肿以至有出血点（斑）。稍用力挤压时，有时可见到稀薄的白色或略带有粉色的少量病理排泄物。
（四）其他临床症状检查 鳄患病后，除可出现前述一般症状外，还可能表现出与疾病关系较密切的相关症状。如与呼吸道疾病有关的咳嗽、张口呼吸、呼吸哆音等临床表现。又如在感染消化道疾病时，常表现有水样排泄物、腥臭或其中含有气泡、坏死的肠黏膜及尚未完全消化的食物等病理症状。