近年来，随着安徽、浙江等地网箱养龟的兴起，各地龟类消毒方法五花八门，如果方法不当，往往导致龟类疾病的发生与蔓延。根据浙江省海宁市龙头阁两栖爬行动物研究所探索的经验，采用如下方法效果明显，供网箱养龟者借鉴与参考。
1、挂袋消毒法。本方法适用于大面积网箱和网箱群消毒，在预防与病情较轻时使用，大多先用易溶固体药物，将药物装入布袋中，挂在网箱水域让其慢慢溶化扩散。多点、小量用药，一般需挂袋3-5天。固体易溶性药物是根据季节性的预防病况来确定药物，可多种药物混合，一般水域性消毒挂袋以生石灰和强氯精为主。
2、涂抹消毒法。本方法可以起捞后逐个进行，将药液涂抹在龟体上，常用的药物及浓度为：福尔马林溶液，浓度为30-40毫克/升；漂白粉溶液，浓度1-2毫克/升；硫酸铜与硫酸亚铁合剂溶液，浓度为0.5-0.7毫克/升，涂抹时避免药物流入龟的口腔内。
3、整体药浴法。本方法可以起捞后整体进行，将龟类捞到配好药剂的池或缸内，根据龟类的大小与病情，确定用药的浓度高低及用药的品种与时间，便于对症下药灵活掌握。整体药浴的龟，沐浴时间严格控制在6分钟以内，让龟体自然晾干后，及时投入网箱。