为更好地控制本病，曾有本病流行的鸡场应在认真做好疫苗接种的同时，严格执行各项生物安全措施。
传染性喉气管炎疫苗是一种强毒疫苗，为了确保疫苗的免疫保护效果，必须用点眼或滴鼻的方式接种。如用饮水免疫方式接种则完全无效，用喷雾方式接种则会引起负反应。因为经点眼方式接种时，疫苗病毒间接到达呼吸道粘膜上皮细胞并在其中生长繁殖，刺激机体产生免疫力。喷雾接种的结果是因疫苗病毒会深入下呼吸道，迅速大量繁殖结果反而造成强毒侵袭。
此外，在实际接种操作中常有遗漏而未接种的鸡，因而这些鸡仍保持对传染性喉气管炎的易感性而可被接种鸡排出的病毒（因通过鸡呼吸道繁殖，其毒力比原来的减弱疫苗病毒要强）感染。如这些病毒传播到附近未接种免疫的鸡群，经多次传代后，其毒力返强，而易造成疾病的爆发。
因此，除非本场有传染性喉气管炎存在时才使用疫苗，否则以不用为好。 在应用疫苗免疫的同时，必须注意采取严格有效的生物安全措施。千万不要将未接种此疫苗的鸡和已接种此疫苗的鸡混在一起。
此外，切实做好环境卫生和消毒工作。垫料和死鸡的处理要严格按要求执行；将其取出鸡舍前要经消毒液喷射，鞋子、衣物、车辆、人员等进入未接种鸡舍时都要清洗消毒，以确保不携带病毒。每个鸡场都要根据当地条件制定一个有效的控制程序，并不断坚持下去。
常用的免疫程序是：蛋鸡和种鸡第一次免疫在35～45日龄，第二次免疫在90日龄。