野生鸟类和驯化禽只身上携带有禽流感、传染性喉气管炎和新城疫病毒，这也威胁到蛋鸡产业。数份报告指出，良好的生物安全保护措施对于保护蛋鸡免遭疾病威胁至关重要。
墨西哥暴发禽流感
据美国农业部动植物卫生检疫局兽医服务处（USDA-APHIS-VS）AngelaPelzel-McCluskey博士提供的消息，2012年夏，墨西哥哈利斯科州暴发了H7N3高致病性禽流感疫情。截止到2012年10月17日，超过1100万只蛋鸡因病毒感染致死，1100万只蛋鸡遭扑杀，蛋鸡损失总计2230万只，经济损失估计达6.38亿美元，疫情波及38家蛋鸡场和6家商品蛋种鸡场。在两种野生鸟类（非迁徙鸟类）身上分离得到了该种病毒。墨西哥卫生当局采取了免疫接种措施，向疫区提供H5毒株疫苗，总投放量超过1.4亿剂。截止到2012年8月，接种疫苗的蛋鸡数量超过1.28亿羽。Pelzel-McCluskey说，她担心这次暴发的疫情还将产生后续影响，这包括：家禽非法交易可能跨越美国边境；美国养殖场工人在节假日期间去看望墨西哥高危地区的亲朋好友，将病毒带回美国；载货卡车出入墨西哥引起病毒传播。因为实施了H5型流感疫苗接种，墨西哥卫生当局可能将难以检测出H7型流感疫情的再度暴发。
传染性喉气管炎
美国CEVABiomune疫苗公司的GeorgeBoggan博士介绍了传染性喉气管炎的病原学、免疫程序以及疫苗类型，并提供了2010-2012年美国爱荷华州、加利福尼亚州、密苏里州、宾夕法尼亚州和亚利桑那州暴发传染性喉气管炎后的最新情况。爱荷华州疫情发生的地区和养殖场无传染性喉气管炎既往病史。高龄鸡群最先发病，并迅速波及整个养殖场，鸡群发病率与死亡率都很高。这是一种毒性很强的病毒，即使鸡胚源疫苗也很难控制。目前，CEVA公司正在使用各种传染性喉气管炎病毒分离株进行禽只攻毒试验，传统疫苗看起来保护力很低。Boggan建议生产者保持高度警惕，以在养殖场内及早发现疫情。当然，保证鸡舍、人和家禽的生物安全才是重中之重。
野生鸟类携带新城疫病毒
美国农业部兽医服务局的BruceThomsen博士提出，美国中西部地区的野生鸟类携有新城疫病毒，那里正面临严重的疾病危险。美国明尼苏达州、爱荷华州和达科他州有许多野生动物自然保护区，为双冠鸬鹚、白鹈鹕和环嘴鸥提供食物和栖息地。目前发现，这些鸟类都携带外源性新城疫（END）病毒，尤其是致命性新城疫病毒。
2012年，明尼苏达州湖区的野生白鹈鹕和鸬鹚中暴发了外源性新城疫疾病。这些野生鸟类在某些地区的死亡率接近50%。通过图形图像，Thomsen展示了明尼苏达州野生鹈鹕和鸬鹚的死亡情况和神经紊乱症状。他强调，如果这种病毒传染给商业家禽，就必须上报国际兽疫局（世界动物卫生组织），这无疑将会严重影响美国家禽产品的出口。
诸如卫可（Virkon）和漂白剂等消毒药均能杀死这种病毒，为防治禽舍内感染这种疾病，生物安全保护措施至关重要，尤其是使野生禽类远离我们的商业鸡群。野生鸟类最近暴发的这次外源性新城疫疫情距离商业蛋鸡鸡群仅一步之遥，并且与2002-2003年暴发于加利福尼亚州、亚利桑那州和内华达州庭院散养鸡群的新城疫疫情具有一定相似之处。
生物安全体系防止病毒入侵
紧随这些有关疾病疫情报告之后的是由美国海兰国际公司IanRu⁃binoff博士所做的生物安全讲座。他说，良好的生物安全体系包括4个方面，首先是意识，其次是结构，第三是运营，最后是文化。Rubinoff强调指出，每一家生产商、养殖场、综合企业、饲料厂、供应商和禽蛋加工商都需要建立生物安全保护体系。
肠炎沙门氏菌感染率低
爱荷华州立大学兽医诊断实验室的TimothyFrana博士汇报了从2010年7月9日到2012年10月11日期间该实验室对肠炎沙门氏菌的检测情况。在此期间，该实验室检测了超过26,750个环境样品，其中包括2314个送检样本和2.06万个浸蛋池样本。在2.6789万个样本中，肠炎沙门氏菌的阳性率只有1.71%。在2314个送检样本中，阳性率仅为9.72%。只有1个浸蛋池样本呈现阳性，而这个样本采自很久以前（2010年夏季）。与蛋鸡群面临的潜在病毒性疾病威胁相比，这是一个好消息。在过去两年，肠炎沙门氏菌的控制工作取得了长足进步。就这次统计而言，生产者努力遵循美国食品和药物管理局的《禽蛋安全法则》取得了非常明显的成效。
蛋鸡的饲养
SparboeFarms公司的KristjanBre⁃gendahl博士详细介绍了青年鸡和产蛋鸡的营养方案，一些关键信息包括：使青年鸡体重和均匀度达标；产蛋期重视补钙，注意预产期和产蛋前期日粮中钙的额外添加；产蛋初期提供高浓度（能量、钙、磷和氨基酸）的营养日粮，满足种鸡的特殊营养需要；产蛋后期控制氨基酸和蛋白质浓度以调节蛋重；产蛋后期提供低溶钙，改善蛋壳质量。
在饲料成本居高不下的情况下，蛋鸡行业还将继续遭遇外源性和高致病性疾病的威胁。环境样品中的肠炎沙门氏菌阳性率正在下降，良好的管理与生物安全保护措施有助于控制疫情的发生。