1、病原的抗原变异一漂移和转换快而频繁，使得现有疫苗的保护率不足或起不到保护作用；
2、饲养管理的不到位，饲料中某些营养的缺乏，导致免疫功能低下，同时由于气候过于干燥，也为病原的传播提供了条件；
3、养禽场密布，缺乏统一的防疫意识为传染病的流行推波助澜；基层兽医诊断手段和水平低下，对养殖户难以做到积极、有效的指导作用。
4、一些肉鸡养殖企业使用新一流疫苗的免疫效果不佳，可能与免疫鸡群在免疫时体内高水平的新城疫抗体的干扰有关。
另外，禽流感灭活疫苗对鸡群的保护具有明显的亚型特异性，不可能防止所有可能的亚型感染。