5月3日，农业部办公厅下发《关于开展跨省调运种用动物、乳用动物专项整治行动的通知》。通知指出，以种畜禽场、乳用动物饲养场（养殖小区）为重点，严把种用动物、乳用动物调运前审批、调运中监管和落地隔离三道关。严厉打击违法违规调运种用动物、乳用动物行为，降低动物疫病传播风险，保障养殖业健康发展。业内人士认为，打击非法跨省调运，短期内可能会减少相关市场的生猪和家禽等供应量，加剧国内各地区间的结构性矛盾，或将影响一些地区的猪价和鸡价。
通知明确了专项整治行动时间为2016年5月至10月，为期6个月，分为三个阶段。分析人士认为，整治行动内容翔实，具有非常高的可操作性，各地方将依照此通知严格执行，此次整治行动的效果将较为显著。
原本市场供应不足的种畜禽可能受到本次行动影响，将产能短期内限制在养殖强省，加速非法产能出清，加剧国内各地区间的结构性矛盾，或减少相关市场生猪和肉鸡等畜禽的后续供应。农业部数据显示，3月份，全国能繁母猪存栏量仅为3760万头，环比止跌持平，同比下降约1.7%。机构调研情况显示，国内种猪销量虽然有所上升，但主要为原有客户补栏需求增长，大规模补栏仍然较为谨慎。据海关数据显示，祖代鸡苗今年1月份引种为零，2月份进口2.35万套。机构预计，今年一季度祖代引种将不超过5万套，全年约在30万套至50万套之间。同时，荷兰引种谈判推迟，英国还在准备手续，西班牙以蛋鸡为主，美法至少需到年底，而肉鸡大规模从英国引种最快也要到9月份。在此背景下，父母代鸡苗短缺明显，价格快速攀升，其4月份售价每套35元至40元，5月报价已达50元，市场预计年内难有回调。
目前，全国猪价已全面破10元/斤，南方部分地区已经涨至11元/斤左右，北方部分地区已经逼近10.5元/斤，不断刷新历史新高。另外，饲料成本继续稳中下降，养殖户玉米到场价格跌至1.79元/公斤，同比下跌26%。豆粕价格涨至2.78元/公斤，同比下跌13.93%，育肥猪配合料价格在2.48元/公斤，同比下跌21%。饲料成本持续下降将显著提升养殖业盈利能力。
随着日益趋严的环保及土地政策推动，畜禽养殖业延续高景气有望超出市场预期。